Megahit是一种用于高通量测序数据的快速和高效的基因组组装软件。它采用了一个基于De Bruijn图的算法来组装测序片段并重建基因组序列。Megahit的设计旨在处理大规模的测序数据，特别是来自Illumina平台的短读长数据。

1、Conda安装：

conda install -c bioconda megahit

2、直接下载二进制文件

wget https://github.com/voutcn/megahit/releases/download/v1.2.9/MEGAHIT-1.2.9-Linux-x86_64-static.tar.gz tar zvxf MEGAHIT-1.2.9-Linux-x86_64-static.tar.gz cd MEGAHIT-1.2.9-Linux-x86_64-static/bin/ #可以看到目录下的可执行文件megahit


megahit界面




示例